Échouages

Résumé du projet

L’Observatoire PELAGIS, Systèmes d’Observation pour la Conservation des Mammifères et Oiseaux Marins (UMS 3462), rassemblent les programmes d’observation et d’expertise sur la conservation des populations de mammifères et oiseaux marins ainsi que la gestion des bases de données associées.

Une des missions consiste à gérer et comprendre la nature des échouages des mammifères marins sur les côtes françaises de métropole et d’Outre-Mer (environ 1000 échouages/an). Le RNE, Réseau National Echouages, mis en place en 1972, est le principal outil de suivi des échouages de mammifères marins. Il est constitué de correspondants locaux qui se tiennent prêts à intervenir lorsqu’un cas se présente. Il est coordonné par l’Observatoire PELAGIS

Depuis 2022, l’arrivée de vétérinaire et de nouveaux protocoles d’examen et d’autopsie concernant la surveillance sanitaire des populations de mammifères marins à fait évoluer les pratiques et modifier l’architecture des données. Le projet « Échouage » s’inscrit dans le cadre d’une refonte du Système d’Information (SI) de l’observatoire PELAGIS ; de la base de données aux applicatifs Web de gestion et visualisation des données Echouage. 

Nom du responsable du projet

Sarah Wund, Willy Dabin

Lien de consultation

http://pelagis.in2p3.fr/public/histo-carto/index.php

Partenaires

• UMS 3462 Observatoire PELAGIS, Systèmes d’Observation pour la Conservation des Mammifères et Oiseaux Marins
• USR 6402 CC-IN2P3, Centre de calcul de l’Institut national de physique nucléaire et de physique des particules (CNRS)

Calendrier de réalisation

• 2022 : conception et modélisation d’une nouvelle base de données Echouage
• 2024 : développement d’une nouvelle interface basée sur le squelette InBORe pour la gestion des échouages. Évolution de la base de données pour prendre en compte (i) les nouveaux protocoles de dissection et d’études sanitaires (ii) les nouvelles données d’analyses des prélèvements. Conception et réalisation d’outils métiers : (i) gestion des échouages de masse (ii) intégration automatisée des prélèvements selon le protocole de dissection (iii) formulaires de recherche paramétrables avec export et formatage du résultat au format CSV.
• 2026 : migration des données de surveillance sanitaire (2022-2025) à l’origine au format Excel 

Interventions de BBEES dans le projet (depuis 2022)

• Refonte et nouvelle modélisation de la  base de données Echouage de l’Observatoire PELAGIS 
• Aide à la conception et co-developpement d’une interface de gestion de la base de données et outils métiers
• Developpement de procédures de migration des données de surveillance sanitaire (Excel) et de la base Echouage2012 (MariaDB)

Personnel BBEES impliqué dans le projet (depuis 2022)

Philippe Grison

Naïma Khrouz (hébergement CCin2p3)

Chloé Martin (depuis 2022)

Date de mise à jour de la fiche projet

20 Fev 2026