Activités

L’équipe Bioinformatique, Génétique, Génomique participe à l’activité de recherche de Muséum national d’Histoire naturelle et du CNRS Ecologie et Environnement par :

•  la mise en place de collaboration impliquant par exemple la prise en charge de tout ou partie des analyses d’un projet, de son design à sa dissémination, développement méthodologique et diffusion des outils et résultats,
• l’encadrement de stagiaires de master ou de doctorant.es, notamment pour l’accompagnement des aspects méthodologiques et bioinformatique,
• la coordination de projets fédérateurs autour d’une thématique ou d’une méthodologie transversale, pouvant intéresser différentes équipes.

Voici quelques exemples de projets menés par des membres de l’équipe :

[en construction]

Ateliers de bioinformatique et de génomique

Les inscriptions aux ateliers 2026 sont ouvertes.

Participation aux enseignements

L’objectif de cette journée est de réunir les personnes du Muséum intéressées par la bioinformatique dans son sens le plus général : analyses de sons, d’images, de données omiques ou autres. Ces journées rassemblent aussi bien des développeur.reuses d’outils, bases de données que des utilisateur.ices curieux.ses.

C’est l’occasion de diffuser des savoir-faire et des problématiques présentes au Muséum mais aussi de discuter méthodologies, ressources et outils communs, à travers des exemples concrets d’utilisation d’outils bioinformatiques.

Prochaine édition le 12 décembre 2025 !
 

Consultez le programme des dernières éditions :
https://bioinfomnhn2024.sciencesconf.org/
https://bioinfomnhn2023.sciencesconf.org/
https://bioinfomnhn2020.sciencesconf.org/

GenRef (Référentiel national de séquences génétiques) est une initiative financée par l’Office français de la biodiversité (OFB) et pilotée par le Muséum national d’Histoire naturelle (MNHN).

Son objectif es de mettre en place un outil national public rendant accessibles des séquences d’ADN de haute qualité associées à des identification taxonomiques fiables pour toutes les espèces présentes en France hexagonale et en Outre-mer.

GenRef a pour ambition d’assurer le contrôle, la validation et la traçabilité des séquences intégrées grâce à des flux de données automatisés, des procédures d’expertise et l’implication forte de la communauté scientifique et taxonomique. Interconnecté avec d’autres référentiels, tels que TAXREF, et avec les principales bases de données génétiques et génomiques nationales et internationales, GenRef fournira un accès à des séquences de référence validées, vérifiables et révisables. Ce cadre garantira la qualité, la fiabilité et l’interopérabilité des données utilisées pour l’identification des espèces, les
études d’ADN environnemental, le suivi d’espèces d’intérêt et d’autres analyses moléculaires, soutenant ainsi la recherche scientifique, et les politiques publiques de connaissance et de conservation de la biodiversité.

L’équipe est pilotée par Nirmala Séon-Massin (DIREX), coordinatrice administrative, avec Rodolphe Rougerie (ISYEB) en tant coordinateur scientifique, et Liliana Ballesteros-Mejia (DIREX - DOHNEE) en tant que cheffe de projet.